『駁二動漫祭』創於2011年，每年11月為南部動漫迷的年度盛會，舊式倉庫不僅是角色扮演愛好者的絕佳拍攝場景，多棟主題之經營方式創造同人販售活動新風貌。每年『駁二當代館』亦搭配『駁二動漫祭』，規劃獨具特色之動漫議題的當代藝術展，探討動漫中的次文化，從新一代動漫創作者的作品觀看社會現象，成為『駁二動漫祭』極具特色的一環。一次次帶狀展覽與活動孕育駁二的動漫能量，逐漸建構出駁二的獨特動漫紋理，因此籌設此常設性之展館—「動漫倉庫」，希望打造動漫族群的專屬基地。